為符合現代化設備需求，新北市立殯儀館與台北地檢署合作，於102年改善解剖室環境及設備，除解剖室內採負壓隔離空調、單一氣流方向來保護法醫及作業人員外，再增加家屬休息室，遺體相驗區及檢查官審訊室，大幅改善解剖室環境，服務家屬；解剖室及館內遺體處理之廢水均採用生物分解處理，符合放流標準。

另查殯儀館非屬廢棄物清理法所稱之事業單位，故所產出的廢棄物，屬於一般廢棄物，因此現階段殯儀館廢棄物之處理，係依照一般廢棄物的清運標準來辦理，然因殯儀館業務性質特殊，有關遺體處理過程中所產生的廢棄物處理流程，民政局已責成殯葬處立即改善，未來採醫療廢棄物的標準來處理。